Le Seimas, le cas échéant, peut former les commissions permanentes pour traiter des problèmes spéciaux. Il y en a 15 :
Commission anticorruption
Commission de la déontologie et des procédures
Commission de problèmes de la région de la Centrale nucléaire d’Ignalina
Commission des affaires de la jeunesse et des sports
Commission des affaires maritimes et de la pêche
Commission de la Constitution
Commission de la prévention de la drogue
Commission des affaires de l’OTAN
Commission du contrôle parlementaire d’opérations d’intelligence
Commission des droits et des affaires des anciens résistants contre les régimes d’occupation et des personnes victimes de ces occupations
Commission de pétitions
Commission chargée du développement régional
Commission de la famille et de l’enfant
Commission de la production et de l’emploi
Commission des représentants du Seimas de la République de Lituanie et de la communauté des Lituaniens américains
Pour résoudre les questions à court terme ou les questions spécialisées, ainsi que pour accomplir des missions concrètes Seimas peut former des commissions d’enquête, de contrôle, de la révision, commissions préparatoires et d’autres commissions provisoires.