Le Seimas constitue les commissions pour délibérer les projets de loi et d’autres sujets qui, conformément à la Constitution, relèvent du champ de compétence du Seimas. Les commissions du Seimas sont censées d’être formées lors de la première session de la législature nouvellement élue, le nombre des membres de la commission ne doit pas être inférieur à 7 et supérieur à 17 (à l’exception de la commission des affaires européennes). Les mandats des membres des commissions sont repartis proportionnellement à la représentation des groupes politiques du Seimas.
Il y a 15 commissions permanentes au Seimas:
Commission de la protection de l’environnement
Commission de l’audit
Commission du budget et des finances
Commission de l’économie
Commission des affaires européennes
Commission pour le développement de la société de l’information
Commission des affaires rurales
Commission de la sécurité nationale et de la défense
Commission des affaires sociales et du travail
Commission des affaires de la santé
Commission de l’éducation, des sciences et de la culture
Commission des affaires de la justice
Commission des affaires étrangères
Commission de l’administration d’état et des affaires municipales
Commission des droits de l’homme
Le cas échéant, le Seimas peut constituer des commissions ad hoc pour traiter des problèmes spécifiques ou constituer des commissions d’enquête, contrôle, révision, préparatoires, rédactionnelles et autres commissions ad hoc pour traiter ou élaborer un sujet précis ou bien pour effectuer d’autres missions qui leur sont chargées par le Seimas.