Gimė 1956 m. gruodžio 8 d. Vilniuje literatūros mokslininkų habil. dr. Janinos Žėkaitės ir Vytauto Kubiliaus šeimoje.
Nuo 1963 m. mokėsi Vilniaus 22-ojoje vidurinėje mokykloje (dabar Mikalojaus Daukšos vidurinė mokykla), ją baigė 1974 m.
1974 m. įstojo į Vilniaus valstybinio universiteto (VVU, dabar Vilniaus universitetas (VU) Fizikos fakultetą, kurį baigė 1979 m. ir įgijo fiziko specialybę.
19811984 m. studijavo VVU aspirantūroje.
19841990 m. dirbo VVU laborantu, inžinieriumi, moksliniu bendradarbiu.
1988 m. įsitraukė į Lietuvos Persitvarkymo Sąjūdžio veiklą. 19901992 m. buvo Sąjūdžio atsakinguoju sekretoriumi.
19921996 m. VI Seimo narys, išrinktas daugiamandatėje rinkimų apygardoje pagal Sąjūdžio koalicijos sąrašą. Seime dirbo Gamtos apsaugos komitete.
19962000 m. VII Seimo narys, išrinktas daugiamandatėje rinkimų apygardoje pagal Tėvynės sąjungos (Lietuvos konservatorių) sąrašą. Seime dirbo Europos reikalų (19971999 m. pirmininkas) ir Teisės ir teisėtvarkos komitetuose. 19961999 m. Seimo Pirmininko pirmasis pavaduotojas.
19992000 m. dešimtosios (XXXI) Vyriausybės Ministras Pirmininkas.
20002004 m. VIII Seimo narys, išrinktas daugiamandatėje rinkimų apygardoje pagal Tėvynės sąjungos (Lietuvos konservatorių) sąrašą. Seime dirbo Biudžeto ir finansų ir Europos reikalų komitetuose.
20042008 m. IX Seimo narys, išrinktas Antakalnio rinkimų apygardoje Nr. 3. Iškėlė Tėvynės sąjunga (konservatoriai, politiniai kaliniai ir tremtiniai, krikščioniškieji demokratai). Seime dirbo Aplinkos apsaugos (20052008 m.), Europos reikalų (20062008 m. pirmininkas), Informacinės visuomenės plėtros (20042005 m.), Kaimo reikalų (2005 m.) komitetuose. 20052006 m. Seimo opozicijos lyderis, 20062008 m. Seimo Pirmininko pavaduotojas. Nuo 2004 m. lapkričio 15 d. iki 2005 m. sausio 25 d. Tėvynės sąjungos frakcijos seniūnas.
2008 m. lapkričio 27 d. paskirtas penkioliktosios (XXXVI) Vyriausybės Ministru Pirmininku.
Tėvynės sąjungos (Lietuvos konservatorių) narys nuo įkūrimo 1993 m. 20002003 m. šios sąjungos pirmininko pirmasis pavaduotojas, nuo 2003 m. gegužės 24 d. pirmininkas. Nuo 2008 m. gegužės 17 d. Tėvynės sąjungos-Lietuvos krikščionių demokratų pirmininkas.
20012003 m. Žinių visuomenės tarybos prie Lietuvos Respublikos Prezidento pirmininkas. 20042008 m. Lietuvos šaudymo sąjungos prezidentas. Nuo 2001 m. tarptautinio Baltijos plėtros forumo Tarptautinės patarėjų tarybos narys. Yra Žinių ekonomikos forumo Politikos komiteto pirmininkas.
Parašė knygas Kodėl krepšinis Lietuvoje gražesnis už politiką (2004 m.) ir Konservatyvioji bendruomenė (2006 m.), taip pat yra knygos ,,Sėkmės Lietuva (Dešinioji Alternatyva) (2004 m.) bendraautoris.
Už nuopelnus Lietuvos valstybei yra įvertintas valstybiniais apdovanojimais Lietuvos nepriklausomybės medaliu, Lietuvos didžiojo kunigaikščio Gedimino ordino Komandoro kryžiumi. Estijos Prezidentas už nuopelnus Estijai apdovanojo 3-iojo laipsnio Marijos žemės kryžiaus ordinu.
Domisi politologine, istorine, žinių ekonomikos literatūra.
Pomėgiai knygos, koncertai, aktyvus poilsis gamtoje.
Moka anglų, rusų kalbas.
Žmona Rasa Lietuvos nacionalinio simfoninio orkestro smuikininkė.
Turi du sūnus. Andrius asociacijos ,,Lietuvos skautija Kernavės tunto vadovas, Vytautas UAB Media contacts direktorius.